بالرغم من النجاح الساحق الذى حققه صاروخ الكوميديا إسماعيل يس، خلال مشواره الفنى، إلا أن مسيرته الفنية تعثرت فى العقد الأخير من حياته، فقد شهد عام 1961 انحسار الأضواء عن يس تدريجيا، وتعرض إلى مآسى عديدة منها إفلاسه، حيث كانت تلاحقه مصلحة الضرائب، لكى تطالبه بمتأخرات أرباحه بالأعوام السابقة .
كما حجزت الضرائب على 'عمارته'، فانهار كل ما بناه، وتخلى عنه أصدقائه المقربون من المنتجين، والذين جنوا من وراء ضحكاته أموالا طائلة .
اضطر إسماعيل يس إلى أن يعود مجددا إلى تقديم المونولوجات فى الملاهى الليلية لكسب العيش، وظل يصارع المرض حتى توفى فى 24 مايو 1972.
من أشهر أعماله السينمائية 'إسماعيل يس فى الأسطول، إسماعيل يس فى البوليس، إسماعيل يس فى مستشفى المجانين، إسماعيل يس يقابل ريا وسكينة، ابن حميدو، إسماعيل يس فى الطيران.